檢測病毒的有效方法

Gerardo Ramos-Mandujano，主要作者為了診斷COV-ID-19，研究醫(yī)生從不同類型的研究樣本(例如鼻咽拭子)中提取SARS-CoV-2病毒RNA，并使用實(shí)時(shí)逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)測定法檢測病毒。但是大流行的規(guī)模可能導(dǎo)致診斷測試所需的基本用品短缺，例如滿足生物安全要求的商業(yè)試劑和實(shí)驗(yàn)室。常規(guī)化學(xué)品的供應(yīng)也很昂貴，這使得低收入國家和偏遠(yuǎn)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)難以獲得它們。

KAUST研究人員已經(jīng)開發(fā)出一種安全，快速，廉價(jià)的測試方法，該方法使用磁性納米粒子檢測研究和廢水樣品中的病毒。無離心方法與基于磁珠的自動(dòng)化系統(tǒng)兼容，該系統(tǒng)已用于處理數(shù)百個(gè)樣品。

我們的基于二氧化硅磁性納米粒子的工作流程可以由任何研究人員從頭開始進(jìn)行組裝。它可與商用病毒RNA提取試劑盒匹敵，同時(shí)降低了處理潛在感染性樣品的風(fēng)險(xiǎn)。”

由于在社區(qū)暴發(fā)前已在廢水中檢測到該病毒，因此密切關(guān)注其在污水中的存在已成為一項(xiàng)重要的公共衛(wèi)生措施。由于存在處理傳染性樣品的風(fēng)險(xiǎn)，這將需要一種安全且易于執(zhí)行的方法，同時(shí)要使用易于獲得的廉價(jià)化學(xué)品。

該技術(shù)在*滅活病毒的通用試劑TRIzol中起作用，從而使研究醫(yī)生可以安全地處理感染性樣品。每次RNA提取僅需0.3美分，該協(xié)議比商業(yè)診斷試劑盒便宜，并且可產(chǎn)生高質(zhì)量的RNA。

他們的方法還可以有效治療其他人類致病病毒，包括甲型和乙型流感以及呼吸道合胞病毒。當(dāng)研究人員在廢水樣品上測試該協(xié)議時(shí)，他們能夠回收88%的合成SARS-CoV-2 RNA合成輸入，使其成為檢測污水中病毒的有效工具。

為了應(yīng)對這些挑戰(zhàn)，生物科學(xué)助理教授Ramos-Mandujano和Mo Li開發(fā)了一種開放源協(xié)議，該協(xié)議使用磁性納米粒子檢測研究和環(huán)境樣品中的病毒RNA，該納米粒子無需離心或使用昂貴的試劑即可分離核酸。

“我們的方法使任何基礎(chǔ)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室都可以用現(xiàn)成的材料制造自制的二氧化硅磁性納米顆粒，”李說。